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コロナ自宅療養解除後の再検査

コロナ自宅療養解除後の再検査

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いつもお世話になっております。
ご教授願いたい件があります。
 例えば、外来透析中で、コロナ療養解除後、3日後に咳の症状があったため透析前に抗原検査をした患者様がいらっしゃるとします。
結果陽性である場合、 感染力は弱くなってるが、コロナウィルスがまだ体内に微量に残っていたため陽性になる場合と、新たに再感染の場合があるとおもいます。
前者の場合、自宅療養は解除になったがまだ症状が継続している状態なので発生届けは出せませんが、後者の場合で 医師がコロナの再感染だと診断した場合、新たな感染として発生届けを出して公費のレセプトを作成さていくのですが、 
前者の場合の抗原検査は算定可能でしょうか? 
また、上記の私の解釈はあっておりますか? 

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